1. مطالعه، تحقیق و اجراى طرحهاى پژوهشى در زمینههای:
الف. تاریخ، فلسفه و مبانى فقه و حقوق اسلامى؛
ب. موضوعات جدید فقهى و فقهى - حقوقى به ویژه در موضوعات مورد نیاز نظام جمهورى اسلامى؛
ج. موضوعات کهن فقهى که به دلایلى نیازمند بازنگرىاند، بهویژه در موضوعات مورد نیاز نظام جمهورى اسلامى؛
د. علوم وابسته به فقه از قبیل اصول، رجال، حدیث و...
ه. قواعد فقهى متناسب با توسعه دانش فقه؛
و. نظام حقوقى اسلام و تطبیق و مقایسه آن با سایر نظامهاى حقوقى
ز. الگوها و نظریههاى کارآمد فقهى و حقوقى؛
ح. شناسایى شبهات مربوط به فلسفه احکام و ارائه تحلیلهاى عقلانى جهت اقناع اذهان مخاطبان؛
2. شناسایى خلأها، نیازها، آسیبها و مشکلات فقهى و حقوقى نظام جمهورى اسلامى؛
3. آسیبشناسى فقهى - حقوقى نهادهاى تقنینى، قضایى و اجرایى نظام جمهورى اسلامى؛
4. ایجاد گروههاى تخصصى جهت اجراى برنامهها و فعالیتهاى پژوهشى؛
5. تهیه مجموعههاى اطلاعرسانى (مأخذشناسى، قاموس، معجم و...)
6. فراهم آوردن زمینه رشد و توسعه دانش و توانایى پژوهشگران پژوهشکده از طریق تشکیل و کارگاههاى آموزشى، برگزارى نشستها و گفتوگوهاى علمى، ایجاد فرصتهاى مطالعاتى و...
7. شناسایى، جذب و به کارگیرى پژوهشگران و صاحبنظران توانمند و حمایت از فقهپژوهان حوزه علمیه جهت زمینهسازى رشد و اعتلاى آنان؛
8. اطلاعرسانى به حوزههاى علمیه در زمینه پرسشها و چالشهاى نوپیداى جامعه و نظام اسلامى در عرصه فقه و حقوق اسلامى؛
9. ارتباط و همکارى با سازمانها، نهادها، مؤسسات و مراکز علمى، پژوهشى و اجرایى به منظور پیشبرد اهداف پژوهشکده؛
10. برقرارى ارتباط فعال و سازنده با دیگر پژوهشکدهها و واحدهاى زیرمجموعه پژوهشگاه با هدف اجراى طرحهاى مشترک و جلوگیرى از انجام کارهاى موازى و تکرارى.