براساس نامه رئیس اداره امور هیأت علمی پژوهشگاه، پرونده ارتقای مرتبه به دانشیاری جناب آقای دکتر اسماعیل آقابابایی در هیأت ممیزه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری مورد تأیید قرار گرفت.
نامبرده دارای آثار و تألیفات متعدد در زمینه مسائل فقهی و حقوقی از جمله «شرکت های هرمی» اثر شایسته تقدیر کتاب فصل جمهوری اسلامی، «مسائل فقهی حقوقی قتل از روی ترحم» اثر شایسته تحسین کتاب سال حوزه، «تأثیر دیدگاه های فقهی بر قوانین کیفری در جرایم علیه تمامیت جسمانی اشخاص» اثر برگزیده دبیرخانه دین پژوهان کشور است.